RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GBP3Q9H0R5 595 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90B2PQ58FF3 399 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 EVC2Q86UK5 1308 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ATF3P18847 181 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PDE3AQ14432 1141 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 HS1BP3Q53T59 392 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 POTEB2H3BUK9 544 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NSD2O96028 1365 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 MNS1Q8NEH6 495 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD1Q15327 319 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 CACNA1FO60840 1977 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NUP160Q12769 1436 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 DACH1Q9UI36 760 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NCOA2Q15596 1464 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PSME1Q06323 249 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 DDX12PQ92771 950 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 STK31Q9BXU1 1019 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ABCC11Q96J66 1382 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 IQGAP2Q13576 1575 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 KIF1BO60333 1816 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 CEP89Q96ST8 783 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 TERF1P54274 439 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PSMA5P28066 241 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ERLIN1O75477 346 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 USP47Q96K76 1375 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NF2P35240 595 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 AMPHP49418 695 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 FEZ1Q99689 392 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 COG3Q96JB2 828 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 RUFY1Q96T51 708 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCE1Q969G3 411 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 CBFA2T2O43439 604 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 JMYQ8N9B5 988 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ERC2O15083 957 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ERLIN2O94905 339 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 MAP9Q49MG5 647 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 HOOK3Q86VS8 718 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GCC1Q96CN9 775 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 LEKR1Q6ZMV7 388 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PRXQ9BXM0 1461 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 EVA1CP58658 441 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 DEF6Q9H4E7 631 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 REREQ9P2R6 1566 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 CNPY4Q8N129 248 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN2AQ12879 1464 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 XBP1P17861 261 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 BECN2A8MW95 431 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms