RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355080.9

PITX2-203, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-203ENST00000355080 ALKQ9UM73 1620 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX2-203ENST00000355080 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX2-203ENST00000355080 NSD2O96028 1365 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 NGEFQ8N5V2 710 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 MORC1Q86VD1 984 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 GOLGA2Q08379 1002 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX2-203ENST00000355080 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 DLC1Q96QB1 1528 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 CABP2Q9NPB3 220 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 STK26Q9P289 416 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 APAF1O14727 1248 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 ABCC11Q96J66 1382 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 SLFN5Q08AF3 891 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
PITX2-203ENST00000355080 A0A1W2PP64 1363 aa25.14■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 PRAM1Q96QH2 718 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 POGKQ9P215 609 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 MED14O60244 1454 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 E9PSI1 815 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 PLIN1O60240 522 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 CFAP53Q96M91 514 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 MLECQ14165 292 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX2-203ENST00000355080 MTHFSP49914 203 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 ZMYM3Q14202 1370 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 RUNDC1Q96C34 613 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.04■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 NLRP1Q9C000 1473 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 CRBNQ96SW2 442 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
PITX2-203ENST00000355080 MYT1Q01538 1121 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 ADGRB2O60241 1585 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 WWC1Q8IX03 1113 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 UBR1Q8IWV7 1749 aa25■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 CDK19Q9BWU1 502 aa25■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 ATP7BP35670 1465 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 TNRQ92752 1358 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 CCDC27Q2M243 656 aa24.95■■□□□ 1.59
PITX2-203ENST00000355080 FYB1O15117 783 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 TECPR2O15040 1411 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 CPS1P31327 1500 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 WDR63Q8IWG1 891 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 CABP1Q9NZU7 370 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 METP08581 1390 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 MSH5O43196 834 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
PITX2-203ENST00000355080 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.89■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 SIRT1Q96EB6 747 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 MS4A1P11836 297 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 NEUROD2Q15784 382 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 BCAR3O75815 825 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 AKAP12Q02952 1782 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX2-203ENST00000355080 ITSN1Q15811 1721 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms