RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
PPP1CC-202ENST00000340766 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
PPP1CC-202ENST00000340766 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.11■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.1■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.09■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC24A1O60721 1099 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.07■■■■■ 4.01
PPP1CC-202ENST00000340766 TMEM94Q12767 1356 aa40.07■■■■■ 4
PPP1CC-202ENST00000340766 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.05■■■■■ 4
PPP1CC-202ENST00000340766 TMF1P82094 1093 aa40.04■■■■■ 4
PPP1CC-202ENST00000340766 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
PPP1CC-202ENST00000340766 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.03■■■■■ 4
PPP1CC-202ENST00000340766 EVC2Q86UK5 1308 aa40■■■■□ 3.99
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
PPP1CC-202ENST00000340766 C14orf37Q86TY3 774 aa39.98■■■■□ 3.99
PPP1CC-202ENST00000340766 FMN2Q9NZ56 1722 aa39.98■■■■□ 3.99
PPP1CC-202ENST00000340766 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 CDCA8Q53HL2 280 aa39.92■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 DCCP43146 1447 aa39.92■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 MSH6P52701 1360 aa39.9■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC7Q96M83 1385 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 CDK19Q9BWU1 502 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF7Q2M1P5 1343 aa39.88■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.88■■■■□ 3.98
PPP1CC-202ENST00000340766 USP32Q8NFA0 1604 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 WASHC2AQ641Q2 1341 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 MYOM1P52179 1685 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 ITSN1Q15811 1721 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.84■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP7BP35670 1465 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 CABP2Q9NPB3 220 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.82■■■■□ 3.96
PPP1CC-202ENST00000340766 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.81■■■■□ 3.96
PPP1CC-202ENST00000340766 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.8■■■■□ 3.96
PPP1CC-202ENST00000340766 ATF3P18847 181 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP1CC-202ENST00000340766 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.75■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 NUTM2FA1L443 756 aa39.73■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 MST1RQ04912 1400 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP1CC-202ENST00000340766 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP1CC-202ENST00000340766 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.67■■■■□ 3.94
PPP1CC-202ENST00000340766 TMC1Q8TDI8 760 aa39.63■■■■□ 3.94
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF1AQ12756 1690 aa39.63■■■■□ 3.93
PPP1CC-202ENST00000340766 AKAP12Q02952 1782 aa39.61■■■■□ 3.93
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.59■■■■□ 3.93
PPP1CC-202ENST00000340766 CABP1Q9NZU7 370 aa39.59■■■■□ 3.93
PPP1CC-202ENST00000340766 CERKQ8TCT0 537 aa39.58■■■■□ 3.93
PPP1CC-202ENST00000340766 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.55■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 SLAIN2Q9P270 581 aa39.55■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 MON2Q7Z3U7 1717 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 PLEKHG3A1L390 1219 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 ESCO1Q5FWF5 840 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.52■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 ORAI2Q96SN7 254 aa39.51■■■■□ 3.92
PPP1CC-202ENST00000340766 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 A0A1W2PP64 1363 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 PANK3Q9H999 370 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 ACEP12821 1306 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.46■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP1CC-202ENST00000340766 TOM1O60784 492 aa39.44■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 BRINP3Q76B58 766 aa39.43■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 USP6P35125 1406 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP1CC-202ENST00000340766 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF20BQ96Q89 1820 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 FOXO3O43524 673 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP1CC-202ENST00000340766 NPHP3Q7Z494 1330 aa39.32■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 SSH2Q76I76 1423 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 PXDNQ92626 1479 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 PSME1Q06323 249 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 KNSTRNQ9Y448 316 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP1CC-202ENST00000340766 PIP4K2BP78356 416 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms