RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.16■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 MADDQ8WXG6 1647 aa23.15■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
PKP3-201ENST00000331563 MLECQ14165 292 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 DIP2BQ9P265 1576 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.13■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.13■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 RICTORQ6R327 1708 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 NOS1P29475 1434 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 IGHDP01880 384 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.1■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.1■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.09■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 MROH2AA6NES4 1674 aa23.09■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.09■■□□□ 1.29
PKP3-201ENST00000331563 INSRP06213 1382 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 IDI1Q13907 227 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 ABCC3O15438 1527 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 BCAR3O75815 825 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 KIF1BO60333 1816 aa23.06■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 GLI2P10070 1586 aa23.06■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 FSD2A1L4K1 749 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 MCM4P33991 863 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.04■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.04■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 PDE4CQ08493 712 aa23.04■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 MRE11P49959 708 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 TRAK2O60296 914 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 SLFN5Q08AF3 891 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP3-201ENST00000331563 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 LAMC1P11047 1609 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 TPM2P07951 284 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 ESPNB1AK53 854 aa23■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 STAC3Q96MF2 364 aa23■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 COG6Q9Y2V7 657 aa22.98■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 IQGAP1P46940 1657 aa22.97■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.97■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.97■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 ZNF521Q96K83 1311 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 PPP2R1AP30153 589 aa22.95■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 STK26Q9P289 416 aa22.95■■□□□ 1.27
PKP3-201ENST00000331563 PANK1Q8TE04 598 aa22.95■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 ADGRB3O60242 1522 aa22.95■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.95■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 SYNMO15061 1565 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 MYOM2P54296 1465 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 APAF1O14727 1248 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 ERBB4Q15303 1308 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 NLRP1Q9C000 1473 aa22.89■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 IFT172Q9UG01 1749 aa22.89■■□□□ 1.26
PKP3-201ENST00000331563 CDCA8Q53HL2 280 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PIK3C2GO75747 1445 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PDE3AQ14432 1141 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 E9PSI1 815 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 ERVK-7P63135 1459 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PPLO60437 1756 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.84■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-201ENST00000331563 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.83■■□□□ 1.24
PKP3-201ENST00000331563 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.83■■□□□ 1.24
PKP3-201ENST00000331563 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-201ENST00000331563 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-201ENST00000331563 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms