RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
PPP4R4-202ENST00000328839 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.25■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 NGLY1Q96IV0 654 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.22■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.22■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 TECPR2O15040 1411 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PIK3C2GO75747 1445 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4R4-202ENST00000328839 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2FA1L443 756 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 RGS12O14924 1447 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC11Q96J66 1382 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.54
PPP4R4-202ENST00000328839 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 FOXO3O43524 673 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 PXDNQ92626 1479 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.12■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 USP21Q9UK80 565 aa37.11■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
PPP4R4-202ENST00000328839 MYOM2P54296 1465 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF1AQ12756 1690 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.01■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.01■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
PPP4R4-202ENST00000328839 SIRT1Q96EB6 747 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4R4-202ENST00000328839 ATRNO75882 1429 aa36.95■■■■□ 3.51
PPP4R4-202ENST00000328839 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAM1Q96QH2 718 aa36.91■■■■□ 3.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.9■■■■□ 3.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.9■■■■□ 3.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.9■■■■□ 3.5
PPP4R4-202ENST00000328839 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
PPP4R4-202ENST00000328839 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.88■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 POGKQ9P215 609 aa36.87■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 DLC1Q96QB1 1528 aa36.85■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 USP32Q8NFA0 1604 aa36.84■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHG5O94827 1062 aa36.82■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 PSME1Q06323 249 aa36.82■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.82■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRB1O14514 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRB2O60241 1585 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.76■■■■□ 3.48
PPP4R4-202ENST00000328839 SLIT2O94813 1529 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCA3Q99758 1704 aa36.74■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.74■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.74■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 SBNO1A3KN83 1393 aa36.72■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 GLI3P10071 1580 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.7■■■■□ 3.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF10O15013 1369 aa36.69■■■■□ 3.46
PPP4R4-202ENST00000328839 EP400Q96L91 3159 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP4R4-202ENST00000328839 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
PPP4R4-202ENST00000328839 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 STAC3Q96MF2 364 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 HRCP23327 699 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ALS2Q96Q42 1657 aa36.58■■■■□ 3.45
PPP4R4-202ENST00000328839 VPS72Q15906 364 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC125Q86Z20 511 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ITSN1Q15811 1721 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM83GA6ND36 823 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.5■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NRAPQ86VF7 1730 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0G2JS52 829 aa36.46■■■■□ 3.43
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