RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327157.3

PRM3-201, Transcript of protamine 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PRM3, Length 424 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3-201ENST00000327157 PHLPP1O60346 1717 aa16.1■□□□□ 0.17
PRM3-201ENST00000327157 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRM3-201ENST00000327157 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.09■□□□□ 0.17
PRM3-201ENST00000327157 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.08■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.08■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.08■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 SHPRHQ149N8 1683 aa16.08■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.07■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 JCADQ9P266 1359 aa16.07■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 KIF1AQ12756 1690 aa16.06■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.06■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.06■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.05■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 STK26Q9P289 416 aa16.05■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 PRAM1Q96QH2 718 aa16.04■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.03■□□□□ 0.16
PRM3-201ENST00000327157 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.02■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 NPHP3Q7Z494 1330 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 RALGAPBQ86X10 1494 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 PXDNQ92626 1479 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 POGKQ9P215 609 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 TRAK1Q9UPV9 953 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 USP32Q8NFA0 1604 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 TONSLQ96HA7 1378 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.98■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 ORAI2Q96SN7 254 aa15.98■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 NEUROD1Q13562 356 aa15.96■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 ITSN1Q15811 1721 aa15.96■□□□□ 0.15
PRM3-201ENST00000327157 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.95■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 ATP7BP35670 1465 aa15.95■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.94■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.94■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.94■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 SBNO1A3KN83 1393 aa15.93■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.93■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.93■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.92■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.92■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.91■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 LRP6O75581 1613 aa15.9■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 SLC24A1O60721 1099 aa15.9■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRM3-201ENST00000327157 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.89■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.88■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 FOXO3O43524 673 aa15.88■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.88■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.87■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 PSME1Q06323 249 aa15.87■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 ARHGEF10O15013 1369 aa15.87■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 CDK19Q9BWU1 502 aa15.86■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 ALS2Q96Q42 1657 aa15.86■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.84■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.84■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 EVC2Q86UK5 1308 aa15.84■□□□□ 0.13
PRM3-201ENST00000327157 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 NUTM2FA1L443 756 aa15.82■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.82■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 ABCA3Q99758 1704 aa15.8■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.8■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.79■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 SSH2Q76I76 1423 aa15.78■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.78■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.77■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 TESK2Q96S53 571 aa15.77■□□□□ 0.12
PRM3-201ENST00000327157 ACEP12821 1306 aa15.76■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 ILDR2Q71H61 639 aa15.76■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 USP6P35125 1406 aa15.76■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 SLIT2O94813 1529 aa15.75■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 AKAP12Q02952 1782 aa15.75■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.74■□□□□ 0.11
PRM3-201ENST00000327157 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms