RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 SIRT1Q96EB6 747 aa32.67■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.65■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 CABP2Q9NPB3 220 aa32.64■■■□□ 2.82
TMIE-201ENST00000326431 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.61■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 PIK3R4Q99570 1358 aa32.59■■■□□ 2.81
TMIE-201ENST00000326431 TMC1Q8TDI8 760 aa32.57■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 CDK19Q9BWU1 502 aa32.57■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 PTCH1Q13635 1447 aa32.57■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.56■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.55■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.54■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 ADGRB2O60241 1585 aa32.54■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 KNSTRNQ9Y448 316 aa32.54■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.51■■■□□ 2.8
TMIE-201ENST00000326431 CCDC184Q52MB2 194 aa32.51■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.51■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 RALBP1Q15311 655 aa32.5■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.49■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 KCNA6P17658 529 aa32.47■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.46■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.45■■■□□ 2.79
TMIE-201ENST00000326431 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.44■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.44■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 USP32Q8NFA0 1604 aa32.43■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 HSPA2P54652 639 aa32.42■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.42■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 MRS2Q9HD23 443 aa32.42■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 A0A1W2PP64 1363 aa32.4■■■□□ 2.78
TMIE-201ENST00000326431 NWD1Q149M9 1564 aa32.38■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 ATP7BP35670 1465 aa32.38■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 CABP1Q9NZU7 370 aa32.37■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.36■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.35■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 STRCQ7RTU9 1775 aa32.35■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.34■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.34■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.33■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
TMIE-201ENST00000326431 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 ITSN1Q15811 1721 aa32.31■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 NLRP13Q86W25 1043 aa32.3■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 AKAP12Q02952 1782 aa32.3■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa32.29■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.29■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 FMN2Q9NZ56 1722 aa32.28■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.28■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.26■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.26■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.26■■■□□ 2.76
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2FA1L443 756 aa32.25■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.25■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 PPP2R1AP30153 589 aa32.23■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.23■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 NSD2O96028 1365 aa32.22■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.2■■■□□ 2.75
TMIE-201ENST00000326431 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
TMIE-201ENST00000326431 MORC1Q86VD1 984 aa32.16■■■□□ 2.74
TMIE-201ENST00000326431 ANKARQ7Z5J8 1434 aa32.16■■■□□ 2.74
TMIE-201ENST00000326431 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.14■■■□□ 2.74
TMIE-201ENST00000326431 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.14■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 FYB1O15117 783 aa32.13■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.12■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 ACEP12821 1306 aa32.11■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.1■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 C14orf37Q86TY3 774 aa32.09■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TMIE-201ENST00000326431 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.06■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa32.06■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 USP6P35125 1406 aa32.05■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 TMEM94Q12767 1356 aa32.02■■■□□ 2.72
TMIE-201ENST00000326431 NME9Q86XW9 330 aa32■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa31.98■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 SSH2Q76I76 1423 aa31.98■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.97■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.96■■■□□ 2.71
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