RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.26■■□□□ 1.95
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CCDC71-201ENST00000321895 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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CCDC71-201ENST00000321895 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.09■■□□□ 1.93
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CCDC71-201ENST00000321895 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.01■■□□□ 1.91
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CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.98■■□□□ 1.91
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CCDC71-201ENST00000321895 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 USP32Q8NFA0 1604 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.92■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.92■■□□□ 1.9
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CCDC71-201ENST00000321895 CABP1Q9NZU7 370 aa26.92■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.92■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.92■■□□□ 1.9
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PP64 1363 aa26.91■■□□□ 1.9
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CCDC71-201ENST00000321895 TMEM94Q12767 1356 aa26.86■■□□□ 1.89
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CCDC71-201ENST00000321895 AKAP12Q02952 1782 aa26.86■■□□□ 1.89
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CCDC71-201ENST00000321895 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.83■■□□□ 1.89
CCDC71-201ENST00000321895 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.83■■□□□ 1.89
CCDC71-201ENST00000321895 DCCP43146 1447 aa26.83■■□□□ 1.88
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CCDC71-201ENST00000321895 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.81■■□□□ 1.88
CCDC71-201ENST00000321895 NSD2O96028 1365 aa26.8■■□□□ 1.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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CCDC71-201ENST00000321895 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CCDC71-201ENST00000321895 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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CCDC71-201ENST00000321895 MSH6P52701 1360 aa26.74■■□□□ 1.87
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CCDC71-201ENST00000321895 ATF3P18847 181 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC71-201ENST00000321895 USP6P35125 1406 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC71-201ENST00000321895 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CCDC71-201ENST00000321895 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.71■■□□□ 1.87
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CCDC71-201ENST00000321895 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.69■■□□□ 1.86
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CCDC71-201ENST00000321895 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.69■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 MST1RQ04912 1400 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 FYB1O15117 783 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 KIF1AQ12756 1690 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 MORC1Q86VD1 984 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 MRS2Q9HD23 443 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.66■■□□□ 1.86
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