RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.31■■□□□ 1.64
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ZNF554-201ENST00000317243 ADGRB1O14514 1584 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.28■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.27■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.27■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.27■■□□□ 1.64
ZNF554-201ENST00000317243 RICTORQ6R327 1708 aa25.26■■□□□ 1.63
ZNF554-201ENST00000317243 CABP2Q9NPB3 220 aa25.26■■□□□ 1.63
ZNF554-201ENST00000317243 NEO1Q92859 1461 aa25.25■■□□□ 1.63
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ZNF554-201ENST00000317243 TSPOAP1O95153 1857 aa25.23■■□□□ 1.63
ZNF554-201ENST00000317243 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.22■■□□□ 1.63
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ZNF554-201ENST00000317243 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.2■■□□□ 1.62
ZNF554-201ENST00000317243 GLI2P10070 1586 aa25.19■■□□□ 1.62
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ZNF554-201ENST00000317243 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.17■■□□□ 1.62
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ZNF554-201ENST00000317243 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.15■■□□□ 1.62
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ZNF554-201ENST00000317243 MTHFSP49914 203 aa25.13■■□□□ 1.61
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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ZNF554-201ENST00000317243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF554-201ENST00000317243 SLC24A1O60721 1099 aa25.07■■□□□ 1.6
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ZNF554-201ENST00000317243 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.07■■□□□ 1.6
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ZNF554-201ENST00000317243 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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ZNF554-201ENST00000317243 IGHDP01880 384 aa24.85■■□□□ 1.57
ZNF554-201ENST00000317243 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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