RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 PANK3Q9H999 370 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRMP28827 1452 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 SLIT1O75093 1534 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 MRS2Q9HD23 443 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 EVC2Q86UK5 1308 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC11Q96J66 1382 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 NEFMP07197 916 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC184Q52MB2 194 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 SIRT1Q96EB6 747 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 TECPR2O15040 1411 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXA3-201ENST00000317201 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 NLRP13Q86W25 1043 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 MED14O60244 1454 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 USP32Q8NFA0 1604 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 CPS1P31327 1500 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 STK26Q9P289 416 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 PRAM1Q96QH2 718 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 EID1Q9Y6B2 187 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 DIP2AQ14689 1571 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 POGKQ9P215 609 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 TMC1Q8TDI8 760 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 METP08581 1390 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA3-201ENST00000317201 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 INSRP06213 1382 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 LTKP29376 864 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 PDE4CQ08493 712 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.41■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.73e-10■■■□□ 17.9
HOXA3-201ENST00000317201 TBX22Q9Y458 520 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
HOXA3-201ENST00000317201 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 NSD2O96028 1365 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 CABP2Q9NPB3 220 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRB2O60241 1585 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 FGD1P98174 961 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 PPP2R1AP30153 589 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 CDK19Q9BWU1 502 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 PIK3R4Q99570 1358 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 AAMPQ13685 434 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 PTCH1Q13635 1447 aa19.34■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.34■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.34■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 ATP7BP35670 1465 aa19.33■□□□□ 0.69
HOXA3-201ENST00000317201 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRUQ92729 1446 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PP64 1363 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 GSE1Q14687 1217 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXA3-201ENST00000317201 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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