RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.54■■□□□ 1.52
MVB12A-201ENST00000317040 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
MVB12A-201ENST00000317040 KIF3BO15066 747 aa24.53■■□□□ 1.52
MVB12A-201ENST00000317040 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.53■■□□□ 1.52
MVB12A-201ENST00000317040 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.51■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 AGLP35573 1532 aa24.51■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 MLECQ14165 292 aa24.5■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 MYOM1P52179 1685 aa24.48■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 SEC24BO95487 1268 aa24.48■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 GGT6Q6P531 493 aa24.48■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 MADDQ8WXG6 1647 aa24.47■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.47■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 MCM4P33991 863 aa24.46■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 BCAR3O75815 825 aa24.46■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 MRE11P49959 708 aa24.46■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 STAC3Q96MF2 364 aa24.46■■□□□ 1.51
MVB12A-201ENST00000317040 RGL3Q3MIN7 710 aa24.45■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.45■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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MVB12A-201ENST00000317040 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.51e-7■■□□□ 13.7
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MVB12A-201ENST00000317040 APAF1O14727 1248 aa24.41■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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MVB12A-201ENST00000317040 SLC24A1O60721 1099 aa24.39■■□□□ 1.5
MVB12A-201ENST00000317040 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.39■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.38■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.37■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.35■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.35■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 TRAK2O60296 914 aa24.34■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.34■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 COG6Q9Y2V7 657 aa24.34■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 DEPDC5O75140 1603 aa24.33■■□□□ 1.49
MVB12A-201ENST00000317040 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 CEP152O94986 1710 aa24.32■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.32■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 PANK1Q8TE04 598 aa24.31■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 KANK1Q14678 1352 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 PTMSP20962 102 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.3■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 WWC1Q8IX03 1113 aa24.29■■□□□ 1.48
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MVB12A-201ENST00000317040 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.29■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 ESPNB1AK53 854 aa24.28■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 TPM2P07951 284 aa24.28■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.28■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 TRPM2O94759 1503 aa24.27■■□□□ 1.48
MVB12A-201ENST00000317040 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.26■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.25■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC3O15438 1527 aa24.25■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.25■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.25■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 SHPRHQ149N8 1683 aa24.24■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 WDR63Q8IWG1 891 aa24.24■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.24■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 ZMYND15Q9H091 742 aa24.24■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.23■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 DDIT3P35638 169 aa24.22■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 HSCBQ8IWL3 235 aa24.2■■□□□ 1.47
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC27Q2M243 656 aa24.2■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 SNX21Q969T3 373 aa24.2■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.19■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 RUNDC1Q96C34 613 aa24.17■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 PTPRTO14522 1441 aa24.17■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.17■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 PTPRMP28827 1452 aa24.16■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 ERVK-7P63135 1459 aa24.16■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 RLBP1P12271 317 aa24.15■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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