RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLFN5Q08AF3 891 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP152O94986 1710 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGHDP01880 384 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLTCL1P53675 1640 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARXQ96QS3 562 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAK2O60296 914 aa22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PANK3Q9H999 370 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC3O15438 1527 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE3AQ14432 1141 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERBB4Q15303 1308 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPATQ14207 1427 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TESK2Q96S53 571 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AAMPQ13685 434 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCAR3O75815 825 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP2R1AP30153 589 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIK3C2GO75747 1445 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 E9PSI1 815 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMF1P82094 1093 aa22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 REREQ9P2R6 1566 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TERF1P54274 439 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NGEFQ8N5V2 710 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOS1P29475 1434 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MADDQ8WXG6 1647 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AGLP35573 1532 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STAC3Q96MF2 364 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF1BO60333 1816 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MROH2AA6NES4 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP7D2Q96T17 732 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRB3O60242 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COG6Q9Y2V7 657 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTMSP20962 102 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYNMO15061 1565 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OFD1O75665 1012 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDIT3P35638 169 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PANK1Q8TE04 598 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYOM2P54296 1465 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APAF1O14727 1248 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSCBQ8IWL3 235 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MLECQ14165 292 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIK3C2BO00750 1634 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IFT172Q9UG01 1749 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IDI1Q13907 227 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GBP4Q96PP9 640 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms