RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 EVA1CP58658 441 aa29.15■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.15■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.14■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.14■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 MIA2Q96PC5 1412 aa29.13■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.13■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 OLFM4Q6UX06 510 aa29.12■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.12■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS37DQ86XT2 251 aa29.11■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.11■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90B2PQ58FF3 399 aa29.11■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP7D2Q96T17 732 aa29.1■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMA5P28066 241 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 PDILTQ8N807 584 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY26PQ9H489 355 aa29.09■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CDR1P51861 262 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CUX1P39880 1505 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTROBQ8N137 903 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC27Q2M243 656 aa29.08■■■□□ 2.25
GNPTAB-201ENST00000299314 MBD3O95983 291 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRGP23470 1445 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.07■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SDF4Q9BRK5 362 aa29.06■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 WASHC4Q2M389 1173 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM5Q9C035 493 aa29.05■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.04■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
GNPTAB-201ENST00000299314 STAC3Q96MF2 364 aa29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PSME1Q06323 249 aa29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RABEP1Q15276 862 aa29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 FSD1Q9BTV5 496 aa29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK4P51957 841 aa29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.99■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CABP2Q9NPB3 220 aa28.99■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CAGE1Q8TC20 777 aa28.99■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM2P49736 904 aa28.99■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SMC2O95347 1197 aa28.98■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R1AP30153 589 aa28.98■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MTHFSP49914 203 aa28.97■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAI3P08754 354 aa28.95■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 KINO60870 393 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
GNPTAB-201ENST00000299314 XBP1P17861 261 aa28.95■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 GCC1Q96CN9 775 aa28.95■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.94■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.94■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM4AO75164 1064 aa28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE3AQ14432 1141 aa28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.93■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.92■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 IL27Q8NEV9 243 aa28.92■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF21BO75037 1637 aa28.92■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CCP110O43303 1012 aa28.92■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 EPS15P42566 896 aa28.92■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 FYB1O15117 783 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 MSH5O43196 834 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 AKNAQ7Z591 1439 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 FIBPO43427 364 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCP20941 246 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCA4P51532 1647 aa28.9■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.9■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 OFD1O75665 1012 aa28.9■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 BACH2Q9BYV9 841 aa28.89■■■□□ 2.22
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC66A2RUB6 948 aa28.89■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 HIP1O00291 1037 aa28.89■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 SPC24Q8NBT2 197 aa28.89■■■□□ 2.21
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms