RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298818.12

ISCA2-201, Transcript of iron-sulfur cluster assembly 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ISCA2, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA2-201ENST00000298818 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 MYOM2P54296 1465 aa25.55■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.55■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.53■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.53■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ISCA2-201ENST00000298818 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ISCA2-201ENST00000298818 HRCP23327 699 aa25.47■■□□□ 1.67
ISCA2-201ENST00000298818 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ISCA2-201ENST00000298818 NUTM2FA1L443 756 aa25.46■■□□□ 1.67
ISCA2-201ENST00000298818 PXDNQ92626 1479 aa25.46■■□□□ 1.67
ISCA2-201ENST00000298818 ADGRB1O14514 1584 aa25.45■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.44■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 SIRT1Q96EB6 747 aa25.44■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 AFF2P51816 1311 aa25.42■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 FOXO3O43524 673 aa25.4■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 USP32Q8NFA0 1604 aa25.39■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.39■■□□□ 1.66
ISCA2-201ENST00000298818 DLC1Q96QB1 1528 aa25.38■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 C8orf37Q96NL8 207 aa25.38■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 KIF1AQ12756 1690 aa25.37■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.37■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 ADAMTS2O95450 1211 aa25.36■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 PRAM1Q96QH2 718 aa25.36■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.36■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
ISCA2-201ENST00000298818 ADGRB2O60241 1585 aa25.32■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 RXRBP28702 533 aa25.32■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.31■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 NGLY1Q96IV0 654 aa25.28■■□□□ 1.64
ISCA2-201ENST00000298818 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.26■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 POGKQ9P215 609 aa25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 RGS12O14924 1447 aa25.25■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 ABCA3Q99758 1704 aa25.24■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.23■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.22■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 STAC3Q96MF2 364 aa25.22■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 USP21Q9UK80 565 aa25.22■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.21■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ISCA2-201ENST00000298818 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.2■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 ATRNO75882 1429 aa25.19■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.19■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.17■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 ALS2Q96Q42 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.17■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.15■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.15■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ISCA2-201ENST00000298818 SBNO1A3KN83 1393 aa25.14■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 SLIT2O94813 1529 aa25.13■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.13■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.13■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 ITSN1Q15811 1721 aa25.12■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 PSME1Q06323 249 aa25.12■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 GLI3P10071 1580 aa25.1■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.1■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 ATP7BP35670 1465 aa25.09■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 PLEKHG5O94827 1062 aa25.09■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.08■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.08■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.08■■□□□ 1.61
ISCA2-201ENST00000298818 EP400Q96L91 3159 aa25.06■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.05■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.05■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.04■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 ARHGEF10O15013 1369 aa25.04■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 NRAPQ86VF7 1730 aa25.03■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 CDK19Q9BWU1 502 aa25.03■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.03■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.02■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.02■■□□□ 1.6
ISCA2-201ENST00000298818 FAM83GA6ND36 823 aa25.01■■□□□ 1.59
ISCA2-201ENST00000298818 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.99■■□□□ 1.59
ISCA2-201ENST00000298818 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms