RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296130.4

CLEC3B-201, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC3B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-201ENST00000296130 LRP6O75581 1613 aa42.46■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 MYOM2P54296 1465 aa42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 CFAP70Q5T0N1 1121 aa42.42■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 STAC3Q96MF2 364 aa42.42■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.39■■■■■ 4.38
CLEC3B-201ENST00000296130 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.38■■■■■ 4.37
CLEC3B-201ENST00000296130 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.38■■■■■ 4.37
CLEC3B-201ENST00000296130 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.34■■■■■ 4.37
CLEC3B-201ENST00000296130 LAMC1P11047 1609 aa42.34■■■■■ 4.37
CLEC3B-201ENST00000296130 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.33■■■■■ 4.37
CLEC3B-201ENST00000296130 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.31■■■■■ 4.36
CLEC3B-201ENST00000296130 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.3■■■■■ 4.36
CLEC3B-201ENST00000296130 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa42.27■■■■■ 4.36
CLEC3B-201ENST00000296130 FOXO3O43524 673 aa42.24■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 AFF2P51816 1311 aa42.23■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2FA1L443 756 aa42.23■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 PRAM1Q96QH2 718 aa42.22■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 RXRBP28702 533 aa42.21■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 C8orf37Q96NL8 207 aa42.21■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 POGKQ9P215 609 aa42.21■■■■■ 4.35
CLEC3B-201ENST00000296130 ADAMTS2O95450 1211 aa42.15■■■■■ 4.34
CLEC3B-201ENST00000296130 NGLY1Q96IV0 654 aa42.15■■■■■ 4.34
CLEC3B-201ENST00000296130 DLC1Q96QB1 1528 aa42.15■■■■■ 4.34
CLEC3B-201ENST00000296130 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 PXDNQ92626 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.11■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 ADGRB1O14514 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 PHF8Q9UPP1 1060 aa42.07■■■■■ 4.33
CLEC3B-201ENST00000296130 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.06■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 KRT28Q7Z3Y7 464 aa42.05■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 PSME1Q06323 249 aa42.04■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa42■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 USP21Q9UK80 565 aa41.99■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 KIF1AQ12756 1690 aa41.99■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.97■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 SBNO1A3KN83 1393 aa41.89■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 ADGRB2O60241 1585 aa41.89■■■■■ 4.3
CLEC3B-201ENST00000296130 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.86■■■■■ 4.29
CLEC3B-201ENST00000296130 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
CLEC3B-201ENST00000296130 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.83■■■■■ 4.29
CLEC3B-201ENST00000296130 ARHGEF10O15013 1369 aa41.81■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.78■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.77■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.77■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 ATRNO75882 1429 aa41.77■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.76■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 RGS12O14924 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
CLEC3B-201ENST00000296130 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.75■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 USP32Q8NFA0 1604 aa41.73■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.72■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.71■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.71■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CLEC3B-201ENST00000296130 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.69■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.69■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 CDK19Q9BWU1 502 aa41.68■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 SLIT2O94813 1529 aa41.64■■■■■ 4.26
CLEC3B-201ENST00000296130 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.63■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.61■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 PLEKHG5O94827 1062 aa41.6■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 NEUROD1Q13562 356 aa41.58■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.57■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 ATP7BP35670 1465 aa41.57■■■■■ 4.25
CLEC3B-201ENST00000296130 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.53■■■■■ 4.24
CLEC3B-201ENST00000296130 FAM83GA6ND36 823 aa41.53■■■■■ 4.24
CLEC3B-201ENST00000296130 VPS72Q15906 364 aa41.52■■■■■ 4.24
CLEC3B-201ENST00000296130 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.49■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.47■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 ACEP12821 1306 aa41.47■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 ITSN1Q15811 1721 aa41.46■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms