RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 TESK2Q96S53 571 aa34.76■■■■□ 3.15
PQLC3-201ENST00000295083 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
PQLC3-201ENST00000295083 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.75■■■■□ 3.15
PQLC3-201ENST00000295083 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
PQLC3-201ENST00000295083 C14orf37Q86TY3 774 aa34.7■■■■□ 3.15
PQLC3-201ENST00000295083 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.68■■■■□ 3.14
PQLC3-201ENST00000295083 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.67■■■■□ 3.14
PQLC3-201ENST00000295083 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.66■■■■□ 3.14
PQLC3-201ENST00000295083 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.65■■■■□ 3.14
PQLC3-201ENST00000295083 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.63■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.59■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 ADGRB2O60241 1585 aa34.59■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 CDK19Q9BWU1 502 aa34.58■■■■□ 3.13
PQLC3-201ENST00000295083 MSH6P52701 1360 aa34.56■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 TMF1P82094 1093 aa34.56■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 EVC2Q86UK5 1308 aa34.56■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 CABP2Q9NPB3 220 aa34.55■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 NUTM2FA1L443 756 aa34.54■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.53■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 SLC24A1O60721 1099 aa34.53■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
PQLC3-201ENST00000295083 ATF3P18847 181 aa34.51■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 CERKQ8TCT0 537 aa34.49■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 DCCP43146 1447 aa34.49■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.47■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.47■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.47■■■■□ 3.11
PQLC3-201ENST00000295083 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.44■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.44■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.43■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 USP32Q8NFA0 1604 aa34.42■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 MST1RQ04912 1400 aa34.41■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 ATP7BP35670 1465 aa34.41■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 CDCA8Q53HL2 280 aa34.41■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC7Q96M83 1385 aa34.38■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 SLAIN2Q9P270 581 aa34.38■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.37■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.37■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.37■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.36■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 ORAI2Q96SN7 254 aa34.35■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.35■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.33■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 CABP1Q9NZU7 370 aa34.33■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.32■■■■□ 3.09
PQLC3-201ENST00000295083 TMC1Q8TDI8 760 aa34.32■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.3■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.29■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.29■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.29■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 TOM1O60784 492 aa34.28■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 MYOM1P52179 1685 aa34.26■■■■□ 3.08
PQLC3-201ENST00000295083 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.25■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 ITSN1Q15811 1721 aa34.25■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 BRINP3Q76B58 766 aa34.25■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.24■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 PIP4K2BP78356 416 aa34.21■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 ACEP12821 1306 aa34.2■■■■□ 3.07
PQLC3-201ENST00000295083 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.19■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 FOXO3O43524 673 aa34.19■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.19■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.16■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 PANK3Q9H999 370 aa34.15■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 A0A1W2PP64 1363 aa34.14■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PQLC3-201ENST00000295083 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.13■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 KIF1AQ12756 1690 aa34.13■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.11■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.1■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 PSME1Q06323 249 aa34.09■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 AKAP12Q02952 1782 aa34.08■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PQLC3-201ENST00000295083 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.06■■■■□ 3.04
PQLC3-201ENST00000295083 USP6P35125 1406 aa34.04■■■■□ 3.04
PQLC3-201ENST00000295083 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.04■■■■□ 3.04
PQLC3-201ENST00000295083 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.02■■■■□ 3.04
PQLC3-201ENST00000295083 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.02■■■■□ 3.04
PQLC3-201ENST00000295083 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 PXDNQ92626 1479 aa34■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 SSH2Q76I76 1423 aa34■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.99■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms