RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ARPC5-201ENST00000294742 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.33■■□□□ 1.33
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ARPC5-201ENST00000294742 TMEM94Q12767 1356 aa23.33■■□□□ 1.32
ARPC5-201ENST00000294742 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.32■■□□□ 1.32
ARPC5-201ENST00000294742 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ARPC5-201ENST00000294742 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.32■■□□□ 1.32
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ARPC5-201ENST00000294742 TMF1P82094 1093 aa23.29■■□□□ 1.32
ARPC5-201ENST00000294742 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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ARPC5-201ENST00000294742 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.28■■□□□ 1.32
ARPC5-201ENST00000294742 SLC24A1O60721 1099 aa23.26■■□□□ 1.31
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ARPC5-201ENST00000294742 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ARPC5-201ENST00000294742 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.25■■□□□ 1.31
ARPC5-201ENST00000294742 C14orf37Q86TY3 774 aa23.24■■□□□ 1.31
ARPC5-201ENST00000294742 CDK19Q9BWU1 502 aa23.24■■□□□ 1.31
ARPC5-201ENST00000294742 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.24■■□□□ 1.31
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ARPC5-201ENST00000294742 CCDC7Q96M83 1385 aa23.22■■□□□ 1.31
ARPC5-201ENST00000294742 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.21■■□□□ 1.31
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ARPC5-201ENST00000294742 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.19■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 DCCP43146 1447 aa23.18■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 MSH6P52701 1360 aa23.18■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 CDCA8Q53HL2 280 aa23.18■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.18■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.17■■□□□ 1.3
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ARPC5-201ENST00000294742 NUTM2FA1L443 756 aa23.16■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 USP32Q8NFA0 1604 aa23.16■■□□□ 1.3
ARPC5-201ENST00000294742 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.14■■□□□ 1.3
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ARPC5-201ENST00000294742 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.12■■□□□ 1.29
ARPC5-201ENST00000294742 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.11■■□□□ 1.29
ARPC5-201ENST00000294742 MST1RQ04912 1400 aa23.11■■□□□ 1.29
ARPC5-201ENST00000294742 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.1■■□□□ 1.29
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ARPC5-201ENST00000294742 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.08■■□□□ 1.29
ARPC5-201ENST00000294742 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.08■■□□□ 1.28
ARPC5-201ENST00000294742 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.08■■□□□ 1.28
ARPC5-201ENST00000294742 CABP1Q9NZU7 370 aa23.07■■□□□ 1.28
ARPC5-201ENST00000294742 TMC1Q8TDI8 760 aa23.06■■□□□ 1.28
ARPC5-201ENST00000294742 ITSN1Q15811 1721 aa23.05■■□□□ 1.28
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ARPC5-201ENST00000294742 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.04■■□□□ 1.28
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ARPC5-201ENST00000294742 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23■■□□□ 1.27
ARPC5-201ENST00000294742 PANK3Q9H999 370 aa23■■□□□ 1.27
ARPC5-201ENST00000294742 PHF8Q9UPP1 1060 aa23■■□□□ 1.27
ARPC5-201ENST00000294742 A0A1W2PP64 1363 aa22.99■■□□□ 1.27
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ARPC5-201ENST00000294742 BRINP3Q76B58 766 aa22.96■■□□□ 1.27
ARPC5-201ENST00000294742 KIF1AQ12756 1690 aa22.95■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.95■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.95■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 AKAP12Q02952 1782 aa22.95■■□□□ 1.26
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ARPC5-201ENST00000294742 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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ARPC5-201ENST00000294742 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.92■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 FOXO3O43524 673 aa22.91■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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ARPC5-201ENST00000294742 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.9■■□□□ 1.26
ARPC5-201ENST00000294742 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.9■■□□□ 1.26
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ARPC5-201ENST00000294742 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.85■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.85■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.85■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 PXDNQ92626 1479 aa22.84■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.83■■□□□ 1.25
ARPC5-201ENST00000294742 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.83■■□□□ 1.25
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