RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 CCDC27Q2M243 656 aa11.21□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 IFT57Q9NWB7 429 aa11.2□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 HIP1O00291 1037 aa11.2□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 MIA2Q96PC5 1412 aa11.2□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 ATF3P18847 181 aa11.2□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 SMARCE1Q969G3 411 aa11.19□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 ERLIN2O94905 339 aa11.19□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.19□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.18□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.17□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.16□□□□□ -0.62
CUX1-201ENST00000292535 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.15□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 GSE1Q14687 1217 aa11.15□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 PDCP20941 246 aa11.15□□□□□ -0.62
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CUX1-201ENST00000292535 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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CUX1-201ENST00000292535 ERC1Q8IUD2 1116 aa11.13□□□□□ -0.63
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CUX1-201ENST00000292535 MYO9BQ13459 2157 aa11.13□□□□□ -0.63
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CUX1-201ENST00000292535 PDILTQ8N807 584 aa11.11□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.11□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 DACH1Q9UI36 760 aa11.11□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 DEF6Q9H4E7 631 aa11.1□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.1□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 CRBNQ96SW2 442 aa11.1□□□□□ -0.63
CUX1-201ENST00000292535 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.1□□□□□ -0.63
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