RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.7■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 STK26Q9P289 416 aa31.69■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.68■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.68■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 DCCP43146 1447 aa31.68■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.66■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
TTLL1-201ENST00000266254 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.63■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC7Q96M83 1385 aa31.63■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.61■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 ABCC11Q96J66 1382 aa31.6■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 TECPR2O15040 1411 aa31.6■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.58■■■□□ 2.65
TTLL1-201ENST00000266254 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 TESK2Q96S53 571 aa31.57■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.56■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.56■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 MST1RQ04912 1400 aa31.56■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.55■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.54■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.53■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 BRINP3Q76B58 766 aa31.53■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 SLC24A1O60721 1099 aa31.52■■■□□ 2.64
TTLL1-201ENST00000266254 TMF1P82094 1093 aa31.51■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.5■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.5■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 PHLPP1O60346 1717 aa31.48■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 SIRT1Q96EB6 747 aa31.47■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 DLC1Q96QB1 1528 aa31.47■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.46■■■□□ 2.63
TTLL1-201ENST00000266254 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.45■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 PRAM1Q96QH2 718 aa31.44■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.43■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 POGKQ9P215 609 aa31.43■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 CDCA8Q53HL2 280 aa31.42■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
TTLL1-201ENST00000266254 JCADQ9P266 1359 aa31.38■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 ORAI2Q96SN7 254 aa31.38■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 NUTM2FA1L443 756 aa31.37■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 ILDR2Q71H61 639 aa31.35■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.34■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
TTLL1-201ENST00000266254 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.32■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 MIER1Q8N108 512 aa31.28■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 EVC2Q86UK5 1308 aa31.27■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 MYOM1P52179 1685 aa31.27■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.27■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.27■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
TTLL1-201ENST00000266254 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.23■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.22■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 ADGRB2O60241 1585 aa31.22■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 ANP32CO43423 234 aa31.21■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 FOXO3O43524 673 aa31.2■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 SHPRHQ149N8 1683 aa31.2■■■□□ 2.59
TTLL1-201ENST00000266254 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.16■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.15■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 KIF1AQ12756 1690 aa31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.14■■■□□ 2.58
TTLL1-201ENST00000266254 LRP6O75581 1613 aa31.13■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 PANK3Q9H999 370 aa31.11■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 PXDNQ92626 1479 aa31.1■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.1■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 CDK19Q9BWU1 502 aa31.09■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 CABP2Q9NPB3 220 aa31.09■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 USP32Q8NFA0 1604 aa31.08■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.08■■■□□ 2.57
TTLL1-201ENST00000266254 PRR36Q9H6K5 1346 aa31.07■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.07■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 SOCS7O14512 581 aa31.06■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.06■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 PSME1Q06323 249 aa31.03■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 TMC1Q8TDI8 760 aa31.03■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
TTLL1-201ENST00000266254 ATP7BP35670 1465 aa31■■■□□ 2.55
TTLL1-201ENST00000266254 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.99■■■□□ 2.55
TTLL1-201ENST00000266254 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms