RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.55■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 PSME1Q06323 249 aa21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 H3BQV1 296 aa21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 IFFO2Q5TF58 517 aa21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 CUL7Q14999 1698 aa21.54■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.53■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.53■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.53■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.52■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.51■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 NLRP6P59044 892 aa21.5■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 TOMM22Q9NS69 142 aa21.5■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.5■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.49■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 NCOA1Q15788 1441 aa21.49■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.49■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGEF11O15085 1522 aa21.49■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 ARID3AQ99856 593 aa21.48■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 CABP1Q9NZU7 370 aa21.48■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 SLFN5Q08AF3 891 aa21.48■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 GCC1Q96CN9 775 aa21.47■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.47■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 RNF20Q5VTR2 975 aa21.47■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 GNAI3P08754 354 aa21.47■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.46■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.46■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 CDK19Q9BWU1 502 aa21.46■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 ERC2O15083 957 aa21.45■■□□□ 1.03
SCARB2-201ENST00000264896 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.45■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.45■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 WWC1Q8IX03 1113 aa21.44■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.43■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 BECN2A8MW95 431 aa21.43■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.43■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 MCTP1Q6DN14 999 aa21.43■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.41■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.4■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 MRE11P49959 708 aa21.4■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 TRAK2O60296 914 aa21.4■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.4■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 RAPGEF3O95398 923 aa21.39■■□□□ 1.02
SCARB2-201ENST00000264896 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 EVA1CP58658 441 aa21.39■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.39■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.38■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF428Q96B54 188 aa21.38■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 RABEP1Q15276 862 aa21.37■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 FCHSD2O94868 740 aa21.37■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 GRIN2AQ12879 1464 aa21.37■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.37■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 ABTB2Q8N961 1025 aa21.36■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.36■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 SLC4A2P04920 1241 aa21.36■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 CPLX1O14810 134 aa21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 GNAI2P04899 355 aa21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 NEK4P51957 841 aa21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.35■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 BICD2Q8TD16 824 aa21.34■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.34■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.34■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 MCM2P49736 904 aa21.33■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 CNTROBQ8N137 903 aa21.33■■□□□ 1.01
SCARB2-201ENST00000264896 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.32■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 MAPKBP1O60336 1514 aa21.31■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.31■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 TRDNQ13061 729 aa21.31■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.31■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.31■■□□□ 1
SCARB2-201ENST00000264896 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
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