RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NGEFQ8N5V2 710 aa24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CASC1Q6TDU7 716 aa24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TNNQ9UQP3 1299 aa24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PDE3AQ14432 1141 aa24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCC2Q92887 1545 aa24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NFKBIBQ15653 356 aa24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DCTN1Q14203 1278 aa24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STK31Q9BXU1 1019 aa24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IGHDP01880 384 aa24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCA8O94911 1581 aa24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NME9Q86XW9 330 aa24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WDR63Q8IWG1 891 aa24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GNAI1P63096 354 aa24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF428Q96B54 188 aa24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIF16BQ96L93 1317 aa24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NLRP6P59044 892 aa24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GSE1Q14687 1217 aa24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLA2R1Q13018 1463 aa24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KDM5CP41229 1560 aa24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FYB1O15117 783 aa24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RLBP1P12271 317 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 USP35Q9P2H5 1018 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KCNJ4P48050 445 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RILPL2Q969X0 211 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM83GA6ND36 823 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MCM10Q7L590 875 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM27P14373 513 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HMMRO75330 724 aa24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FCHSD2O94868 740 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms