RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SHPRHQ149N8 1683 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXC6-201ENST00000243108 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC6-201ENST00000243108 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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HOXC6-201ENST00000243108 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.98■■□□□ 1.59
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HOXC6-201ENST00000243108 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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HOXC6-201ENST00000243108 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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HOXC6-201ENST00000243108 DLC1Q96QB1 1528 aa24.89■■□□□ 1.58
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HOXC6-201ENST00000243108 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXC6-201ENST00000243108 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS2O95450 1211 aa24.75■■□□□ 1.55
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HOXC6-201ENST00000243108 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 TONSLQ96HA7 1378 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 ATP7BP35670 1465 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 PSME1Q06323 249 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 SBNO1A3KN83 1393 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC6-201ENST00000243108 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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HOXC6-201ENST00000243108 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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HOXC6-201ENST00000243108 CDK19Q9BWU1 502 aa24.57■■□□□ 1.52
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HOXC6-201ENST00000243108 RGS12O14924 1447 aa24.56■■□□□ 1.52
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HOXC6-201ENST00000243108 ATRNO75882 1429 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXC6-201ENST00000243108 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXC6-201ENST00000243108 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF10O15013 1369 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 SLIT2O94813 1529 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXC6-201ENST00000243108 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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