RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 USP19O94966 1318 aa28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 AAMPQ13685 434 aa28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RUNDC1Q96C34 613 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NOS1P29475 1434 aa28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PANK1Q8TE04 598 aa28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 COG6Q9Y2V7 657 aa28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MORC1Q86VD1 984 aa28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 USP32Q8NFA0 1604 aa28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CD109Q6YHK3 1445 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR63Q8IWG1 891 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMYM3Q14202 1370 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRB1O14514 1584 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC27Q2M243 656 aa28.45■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.45■■■□□ 2.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PPLO60437 1756 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP1Q9C000 1473 aa28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC24BO95487 1268 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DIP2BQ9P265 1576 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GLI2P10070 1586 aa28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NEUROD2Q15784 382 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NPATQ14207 1427 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RLBP1P12271 317 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MTHFSP49914 203 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP53Q96M91 514 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 BECN1Q14457 450 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 NSD2O96028 1365 aa28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TNNQ9UQP3 1299 aa28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRB2O60241 1585 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.26■■■□□ 2.12
HTATSF1-201ENST00000218364 EVC2Q86UK5 1308 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 NEO1Q92859 1461 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCC3O15438 1527 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPOAP1O95153 1857 aa28.2■■■□□ 2.11
HTATSF1-201ENST00000218364 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3C2BO00750 1634 aa28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 GGT6Q6P531 493 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCC11Q96J66 1382 aa28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1-201ENST00000218364 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 POGKQ9P215 609 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RAPGEF3O95398 923 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CABP2Q9NPB3 220 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-201ENST00000218364 IL16Q14005 1332 aa28.11■■■□□ 2.09
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