RNA–Protein interactions for RNA: YOR359W

VTS1, Transcript of Flap-structured DNA-binding and RNA-binding protein, yeast

Gene VTS1, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VTS1	YOR359W	YDR010C	Q12426	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YKL097C	P34245	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	MRX7	P53869	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	FYV12	Q08559	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YGL149W	P53116	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTS1	YOR359W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	COX14	P39103	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	SNA2	P56508	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YBR219C	P38317	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	BSC4	P53841	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	POR2	P40478	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	SIP18	P50263	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YCR001W	P25347	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	COX23	P38824	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	SDH6	Q3E785	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	ATP17	Q06405	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTS1	YOR359W	AQY2	P0CD90	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YER084W	P40057	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	VAM10	Q08474	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	CCW12	Q12127	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YGR025W	P53216	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	RTC6	O14464	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YBR027C	P38220	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VTS1	YOR359W	YHR125W	P38831	101 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YIL086C	P40503	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	FAB1	P34756	2278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	PMP3	P87284	55 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	LCL2	Q08045	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VTS1	YOR359W	RPL39	P04650	51 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	IGD1	P43598	195 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	SGF11	Q03067	99 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	ECM19	Q06011	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	AUA1	P32450	94 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	MVB12	P42939	101 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YCR041W	P37265	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VTS1	YOR359W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	YAR064W	P39563	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	DDR2	P89113	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTS1	YOR359W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VTS1	YOR359W	HOR7	Q05827	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VTS1	YOR359W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VTS1	YOR359W	YDR210W	Q03482	75 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VTS1	YOR359W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VTS1	YOR359W	COX8	P04039	78 aa		4.53	□□□□□ -1.69
VTS1	YOR359W	RPC10	P40422	70 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VTS1	YOR359W	YEL014C	P39999	101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VTS1	YOR359W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VTS1	YOR359W	YOR072W	Q08486	104 aa		4.46	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		4.46	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		4.45	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.43	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.41	□□□□□ -1.7
VTS1	YOR359W	YCL042W	P25572	119 aa		4.4	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.4	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.39	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	HFA1	P32874	2273 aa		4.38	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	IRA2	P19158	3079 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	YLR255C	O13574	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VTS1	YOR359W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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