RNA–Protein interactions for RNA: YKR029C

SET3, Transcript of Defining member of the SET3 histone deacetylase complex, yeast

Gene SET3, Length 2,256 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET3	YKR029C	PMP3	P87284	55 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	COX9	P07255	59 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	CYB5	P40312	120 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	APS2	Q00381	147 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	SCP1	Q08873	200 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	PCC1	Q3E833	88 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SET3	YKR029C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	DAD1	Q12248	94 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	UBC5	P15732	148 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	MRP17	P28778	131 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	COX23	P38824	151 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YEA6	P39953	335 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SPI1	P40092	148 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YER187W	P40102	141 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	GTT1	P40582	234 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SNN1	P48232	102 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	COA2	Q3E823	68 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SHU1	P38751	150 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YHR130C	P38834	111 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YBR090C	P38253	122 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	RPC10	P40422	70 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YDR210W	Q03482	75 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	FPR2	P32472	135 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YHL005C	P38752	130 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SWM2	P40342	146 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	DDR2	P89113	61 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	COX7	P10174	60 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YAR029W	P39549	74 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	BSC4	P53841	131 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YMR082C	Q04276	118 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YAL065C	O13511	128 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	PAU19	P0CE85	124 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	PAU3	P25610	124 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	PAU15	P40585	124 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	VMA21	P41806	77 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	MRPS12	P53732	153 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	QCR9	P22289	66 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	HUR1	P45820	110 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YDR042C	Q03205	200 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	PAU16	P35994	123 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YGR164W	P53291	111 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YOR105W	Q08504	108 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	COX19	Q3E731	98 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	TOS6	P48560	102 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SET3	YKR029C	SRB6	P32570	121 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU7	P39545	55 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU5	P43575	122 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU4	P53427	120 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YNL190W	P53872	204 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YLR255C	O13574	117 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU1	P0CE88	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU14	P0CE89	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU6	P0CE90	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU18	P0CE91	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU8	P0CE92	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU11	P0CE93	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YBR016W	P38216	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU13	P38725	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU10	Q03050	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	PAU20	Q08322	120 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SET3	YKR029C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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