RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	MED23	Q9ULK4	1368 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340		F8VZ95	297 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	AQP7	O14520	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ADAM20	O43506	726 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	DTNB	O60941	627 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TRIM16	O95361	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	LRG1	P02750	347 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CBX3	Q13185	183 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	PXK	Q7Z7A4	578 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TAGAP	Q8N103	731 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CASP10	Q92851	521 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	DNAJC18	Q9H819	358 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	SNX15	Q9NRS6	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CDC14C	A4D256	554 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	KDM1A	O60341	852 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF254	O75437	659 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM155B	O75949	473 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	OLFM2	O95897	454 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	PLCG1	P19174	1290 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	DIO1	P49895	249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CTAG1A	P78358	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	NEDD9	Q14511	834 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	LRRC14	Q15048	493 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	WDR93	Q6P2C0	686 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	AGR3	Q8TD06	166 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CUL5	Q93034	780 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	OPA3	Q9H6K4	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	GLRX2	Q9NS18	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	PTGES3L	E9PB15	166 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340		H3BM21	787 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	GPR25	O00155	361 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ARVCF	O00192	962 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	REC8	O95072	547 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	AOAH	P28039	575 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	GYG1	P46976	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	RABIF	P47224	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ETV1	P50549	477 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	CD83	Q01151	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	FMO1	Q01740	532 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	POU4F3	Q15319	338 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	TBCC	Q15814	346 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM71B	Q8TC56	605 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MFSD8-223	ENST00000641340	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.37	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms