RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ARCQ7LC44 396 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MCUQ8NE86 351 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAF2Q96CS3 445 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CPXM1Q96SM3 734 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ACAD9Q9H845 621 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 GPAMQ9HCL2 828 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 USP18Q9UMW8 372 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 E5RJQ4 531 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FCHO1O14526 889 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TM7SF2O76062 418 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RBP3P10745 1247 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MYL2P10916 166 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PYGBP11216 843 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NEFHP12036 1026 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SKIP12755 728 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MIPP30301 263 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TUBP50607 506 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ACTR3P61158 418 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAAP100Q0VG06 881 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 OVGP1Q12889 678 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MUM1Q2TAK8 710 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SPATA18Q8TC71 538 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 AFG1LQ8WV93 481 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SDCBP2Q9H190 292 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KRT82Q9NSB4 513 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PAK5Q9P286 719 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CAPN9O14815 690 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 HMGCRP04035 888 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ERBB2P04626 1255 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 INHBAP08476 426 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 AOC1P19801 751 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BGNP21810 368 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TGM2P21980 687 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CRABP2P29373 138 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CRHR1P34998 444 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ROR1Q01973 937 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BTKQ06187 659 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF699Q32M78 642 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CES4AQ5XG92 561 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ATG16L1Q676U5 607 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TEKT4Q8WW24 435 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PEBP4Q96S96 227 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FAM159BA6NKW6 160 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 DPYSL4O14531 572 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KRT36O76013 467 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KRT37O76014 449 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GSRP00390 522 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SERPINA6P08185 405 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 IL4RP24394 825 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GPD2P43304 727 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 WASHC5Q12768 1159 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PDK2Q15119 407 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 BBS9Q3SYG4 887 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms