RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TP53BP2Q13625 1128 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LY6KQ17RY6 165 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 NRN1LQ496H8 165 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SSH3Q8TE77 659 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LPIN2Q92539 896 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RTKNQ9BST9 563 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 GLOD4Q9HC38 313 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 DKK2Q9UBU2 259 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 HMX3A6NHT5 357 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LPXNO60711 386 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SRGNP10124 158 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 KLRK1P26718 216 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RBL1P28749 1068 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 AKT1P31749 480 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ITIH3Q06033 890 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FHL3Q13643 280 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TAF12Q16514 161 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR149Q86SP6 731 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 DTX2Q86UW9 622 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SYNE4Q8N205 404 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 GLG1Q92896 1179 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 HAPLN3Q96S86 360 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ZAR1LA6NP61 321 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 VNN1O95497 513 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ERBB2P04626 1255 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 NXPH1P58417 271 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TIRAPP58753 221 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SCAPQ12770 1279 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 GRM4Q14833 912 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FZD1Q9UP38 647 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LZTS1Q9Y250 596 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 A1L4Q6 167 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 EXOC5O00471 708 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RHOP08100 348 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PNLIPRP1P54315 467 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 CTSWP56202 376 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 RSC1A1Q92681 617 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FKBP10Q96AY3 582 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 TBATAQ96M53 351 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 MAF1Q9H063 256 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 COL15A1P39059 1388 aa6.21□□□□□ -1.41
SMARCA2-241ENST00000635397 PSMD9O00233 223 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCA2-241ENST00000635397 TAF5LO75529 589 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms