RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 PHF11Q9UIL8 331 aa8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 PRODHO43272 600 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 GH1P01241 217 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 SCP2P22307 547 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 LDHDQ86WU2 507 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 CCDC185Q8N715 623 aa8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 TIMM44O43615 452 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 DGAT1O75907 488 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 SGSM3Q96HU1 749 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 MTMR2Q13614 643 aa8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.5□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 SSNA1O43805 119 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF333Q96JL9 665 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 SMCO1Q147U7 214 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 CHI3L2Q15782 390 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 SVOPQ8N4V2 548 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 RNF149Q8NC42 400 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 MED15Q96RN5 788 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 35.6
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SPTAN1-222ENST00000630804 WDR41Q9HAD4 459 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 RNF112Q9ULX5 631 aa8.49□□□□□ -1.05
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SPTAN1-222ENST00000630804 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.49□□□□□ -1.05
SPTAN1-222ENST00000630804 UBE2QL1A1L167 161 aa8.49□□□□□ -1.05
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