RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	MYL3	P08590	195 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	STAG3L1	P0CL83	205 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	T-ENOL	P0DO92	83 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MAN1A1	P33908	653 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GPC5	P78333	572 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TRPC3	Q13507	836 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	RCN1	Q15293	331 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KYAT1	Q16773	422 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF677	Q86XU0	584 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PHC3	Q8NDX5	983 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	C2CD2L	O14523	706 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LYN	P07948	512 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FAM200B	P0CF97	657 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CXCL8	P10145	99 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MYBL1	P10243	752 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ITIH2	P19823	946 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FCGRT	P55899	365 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	BEX3	Q00994	111 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SPARCL1	Q14515	664 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	STAT4	Q14765	748 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FYB2	Q5VWT5	728 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM192	Q8IY95	271 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PRELID2	Q8N945	189 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	C18orf8	Q96DM3	657 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	HIC2	Q96JB3	615 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMAP	O00193	183 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PSMG1	O95456	288 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ECEL1	O95672	775 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH1A1	P00352	501 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2C9	P11712	490 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	AKR1A1	P14550	325 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MYL6	P60660	151 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC43	Q8N309	656 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MGAM	O43451	1857 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LACTBL1	A8MY62	500 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CAPN9	O14815	690 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ATP9B	O43861	1147 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ANK1	P16157	1881 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	USP4	Q13107	963 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ITGA9	Q13797	1035 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PDK4	Q16654	411 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf82	Q8WW14	230 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PPCS	Q9HAB8	311 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		15.99	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FAM170A	A1A519	330 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659		F8W8V4	182 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GPR32	O75388	356 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ASMTL	O95671	621 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GAS8	O95995	478 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CALCA	P01258	141 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FAM163B	P0C2L3	166 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM17	P78536	824 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRO	Q16827	1216 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KLC3	Q6P597	504 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM270	Q6UE05	265 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	RELL1	Q8IUW5	271 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	UBR7	Q8N806	425 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TRPV1	Q8NER1	839 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PLVAP	Q9BX97	442 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		15.98	■□□□□ 0.15

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