RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	BCL9	O00512	1426 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	JTB	O76095	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ONECUT2	O95948	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CELA2A	P08217	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KCNJ5	P48544	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SOX8	P57073	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LOXL3	P58215	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GRM1	Q13255	1194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IQCB1	Q15051	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	JUP	P14923	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	HDC	P19113	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SATB1	Q01826	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TFF2	Q03403	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DDB2	Q92466	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	VCAN	P13611	3396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KANK1	Q14678	1352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	QSOX1	O00391	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	OFD1	O75665	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DNAJB5	O75953	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PDHA1	P08559	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PF4V1	P10720	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PCSK6	P29122	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF134	P52741	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	E2F2	Q14209	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DCLK1	O15075	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	UNC5C	O95185	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TH	P07101	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GRP	P07492	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	VIPR2	P41587	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF81	P51508	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LILRA4	P59901	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SNX27	Q96L92	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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