RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609045.1

TAF4-209, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 4, human

TSL 4

Gene TAF4, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF4-209	ENST00000609045	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	NR1H3	Q13133	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045		Q6ZS52	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TAF4-209	ENST00000609045	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	COCH	O43405	550 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CD58	P19256	250 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DRD1	P21728	446 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	HOXA6	P31267	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PPP1R2	P41236	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PGF	P49763	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	MXI1	P50539	228 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	STIM1	Q13586	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	MORC3	Q14149	939 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045		K7ESF4	209 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PSMA7	O14818	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ATG13	O75143	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ADORA2B	P29275	332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	TUB	P50607	506 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	RAD23B	P54727	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	GMIP	Q9P107	970 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PMM2	O15305	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	NFATC1	O95644	943 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	EGF	P01133	1207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	RUBCN	Q92622	972 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CD101	Q93033	1021 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	HR	O43593	1189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CNR2	P34972	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	KIF11	P52732	1056 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DMWD	Q09019	674 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DHCR24	Q15392	516 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	ARID3A	Q99856	593 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF4-209	ENST00000609045	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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