RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 TACC1O75410 805 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALDH1A2O94788 518 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADH1CP00326 375 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 P2RY2P41231 377 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTGER3P43115 390 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP3CCP48454 512 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASIC1P78348 528 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 DEFB124Q8NES8 71 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 WHAMMQ8TF30 809 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPACA7Q96KW9 195 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM9Q9C026 710 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNMDQ9H2S6 317 aa22.18■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TGFB1I1O43294 461 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAM23O75077 832 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PI4KAP42356 2102 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAPK8P45983 427 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUCB2P80303 420 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP24A1Q07973 514 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 E2F4Q16254 413 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FBXO32Q969P5 355 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 WASF3Q9UPY6 502 aa22.17■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 A8MXQ7 604 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAP3K13O43283 966 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 COCHO43405 550 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 F13A1P00488 732 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 YWHAQP27348 245 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYL6P60660 151 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PSMD6Q15008 389 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PGBD3Q8N328 593 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 NAT16Q8N8M0 369 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF516Q92618 1163 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 DHX58Q96C10 678 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.16■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEACAM1P13688 526 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 GRIA2P42262 883 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PKP1Q13835 747 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 STK38Q15208 465 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 EOGTQ5NDL2 527 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUP93Q8N1F7 819 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 WBP2Q969T9 261 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCNK16Q96T55 309 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.15■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.15■■□□□ 1.14
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VIM-AS1-202ENST00000605833 CACNA1GO43497 2377 aa22.14■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYH10P35580 1976 aa22.14■■□□□ 1.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLSTN1O94985 981 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 IRF1P10914 325 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 CASP1P29466 404 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRPC3Q13507 836 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM35AQ86V20 835 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 E2F8A0AVK6 867 aa22.13■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNFRSF10BO14763 440 aa22.13■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 ENGP17813 658 aa22.13■■□□□ 1.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 ITPKAP23677 461 aa22.13■■□□□ 1.13
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