RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN5O00501 218 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF10BO14763 440 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZZEF1O43149 2961 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 COCHO43405 550 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM23O75077 832 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF9P0C862 333 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 YWHAQP27348 245 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIA2P42262 883 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF4P43489 277 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ASIC1P78348 528 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 AMPD3Q01432 767 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 KDSRQ06136 332 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 LMAN2Q12907 356 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 EOGTQ5NDL2 527 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 LY6G5CQ5SRR4 150 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP93Q8N1F7 819 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 FRMD1Q8N878 549 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO32Q969P5 355 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 OTUB2Q96DC9 234 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CUEDC2Q9H467 287 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MTMR6Q9Y217 621 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP192Q8TEP8 1941 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CLIC2O15247 247 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SPINK2P20155 84 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ATICP31939 592 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGER3P43115 390 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBP50607 506 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP2J2P51589 502 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MYL6P60660 151 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 GAD2Q05329 585 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 EHHADHQ08426 723 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPC3Q13507 836 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 STK38Q15208 465 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 UAP1L1Q3KQV9 507 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT12Q8IV01 421 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGB4Q8WW32 186 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF516Q92618 1163 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 DHX58Q96C10 678 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNK16Q96T55 309 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 IL37Q9NZH6 218 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 GON4LQ3T8J9 2241 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PCNX2A6NKB5 2137 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP8B3O60423 1300 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SPTLC2O15270 562 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP3K13O43283 966 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP6R2O75170 966 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ENGP17813 658 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 DPP6P42658 865 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A3P53794 718 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-226ENST00000593200 HECTD3Q5T447 861 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms