RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 LILRB5O75023 590 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 BMP6P22004 513 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 STIM1Q13586 685 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ZNF394Q53GI3 561 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TATDN2Q93075 761 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ARID3AQ99856 593 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.69□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HHLA1C9JL84 531 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 BIN1O00499 593 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 COCHO43405 550 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 EGFP01133 1207 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PGFP49763 221 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 GALK1P51570 392 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 AMPD2Q01433 879 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 MORC3Q14149 939 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PPP2R5DQ14738 602 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HECTD3Q5T447 861 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SLC35C1Q96A29 364 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CISHQ9NSE2 258 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.68□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 K7ESF4 209 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 NFATC1O95644 943 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HOXC13P31276 330 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 PPP1R2P41236 205 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TUBP50607 506 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DMWDQ09019 674 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TTI2Q6NXR4 508 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 NELFBQ8WX92 580 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CD101Q93033 1021 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CEP63Q96MT8 703 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.67□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CYP26A1O43174 497 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 RNF40O75150 1001 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CYP17A1P05093 508 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DRD1P21728 446 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FNTBP49356 437 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 RAD23BP54727 409 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 NRLP54845 237 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 NR1H3Q13133 447 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 GAB4Q2WGN9 574 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DCLK2Q8N568 766 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TTC39CQ8N584 583 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DUSP16Q9BY84 665 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 EPC1Q9H2F5 836 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.66□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 TLR5O60602 858 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 OPRD1P41143 372 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 FMO5P49326 533 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 STX17P56962 302 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 LRMPQ12912 555 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 CUL2Q13617 745 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 DHCR24Q15392 516 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 WBP2Q969T9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 EXOC4Q96A65 974 aa14.65□□□□□ -0.06
APOC1-208ENST00000592535 HINFPQ9BQA5 517 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms