RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP93Q8N1F7 819 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PHTF2Q8N3S3 785 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 WHAMMQ8TF30 809 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SCFD1Q8WVM8 642 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK16Q96T55 309 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CUEDC2Q9H467 287 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 WASF3Q9UPY6 502 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA7Q8IZY2 2146 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 STAU1O95793 577 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIA2P42262 883 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 EOGTQ5NDL2 527 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6G5CQ5SRR4 150 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CNNM4Q6P4Q7 775 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMCX6Q7L4S7 300 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEFF1Q8IYR6 380 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO32Q969P5 355 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D14Q9P2M4 693 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE4BO95155 1302 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F8A0AVK6 867 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK2P20155 84 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGER3P43115 390 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 EHHADHQ08426 723 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC3Q13507 836 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 LPCAT2Q7L5N7 544 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZD8Q8NEN9 1154 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAMP5Q8TAC9 235 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGB4Q8WW32 186 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA7Q96KW9 195 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SMYD3Q9H7B4 428 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM74BQ9NUR3 256 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP205Q92621 2012 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTLC2O15270 562 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM1P13688 526 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP1P29466 404 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP4P49662 377 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 AMPD3Q01432 767 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP7D1Q3KQU3 841 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 UAP1L1Q3KQV9 507 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM61Q5EBN2 209 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SHC4Q6S5L8 630 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM35AQ86V20 835 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHO2Q8TD55 490 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 OVCA2Q8WZ82 227 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf25Q9BPX7 421 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FRYQ5TBA9 3013 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF10BO14763 440 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 STX6O43752 255 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP6R2O75170 966 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ATICP31939 592 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF4P43489 277 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A3P53794 718 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH8P55286 799 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GAD2Q05329 585 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR9Q6ZVX9 377 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT16Q8N8M0 369 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 WBP2Q969T9 261 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CCSER2Q9H7U1 834 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 THADAQ6YHU6 1953 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K13O43283 966 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HECTD3Q5T447 861 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC13DQ70J99 1090 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 IQUBQ8NA54 791 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB124Q8NES8 71 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUB2Q96DC9 234 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 BLZF1Q9H2G9 400 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 GMIPQ9P107 970 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PHACTR2O75167 634 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LMAN2Q12907 356 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX30Q5VWJ9 437 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT12Q8IV01 421 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf56Q8IXR9 622 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PGBD3Q8N328 593 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MED10Q9BTT4 135 aa27.2■■□□□ 1.94
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