RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-208ENST00000586312 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 WHAMMQ8TF30 809 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NELL1Q92832 810 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 RNF38Q9H0F5 515 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 EBF3Q9H4W6 596 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.57□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 AP1G2O75843 785 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 USP17L7P0C7H9 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CCDC130P13994 396 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 LRMPQ12912 555 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TAF10Q12962 218 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CUL2Q13617 745 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 RUNX3Q13761 415 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 PON2Q15165 354 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 GBP6Q6ZN66 633 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 C12orf29Q8N999 325 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 MSANTD3Q96H12 275 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SMOQ99835 787 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 KRT82Q9NSB4 513 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CISHQ9NSE2 258 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 IL37Q9NZH6 218 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 HESX1Q9UBX0 185 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FRYLO94915 3013 aa14.56□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 LAMTOR5O43504 91 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CILPO75339 1184 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 OLFM2O95897 454 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TCF3P15923 654 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 HDCP19113 662 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 HOXC13P31276 330 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TPM4P67936 248 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 MTF1Q14872 753 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 MAN2A1Q16706 1144 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ZNF394Q53GI3 561 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NUP93Q8N1F7 819 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.55□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ABL1P00519 1130 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CKMP06732 381 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CD19P15391 556 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ADORA2BP29275 332 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 PGFP49763 221 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 MFAP3P55082 362 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CCINQ13939 588 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 EML3Q32P44 896 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 Q6ZS52 159 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 TATDN2Q93075 761 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NACA2Q9H009 215 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 COMMD8Q9NX08 183 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.54□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.53□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 NUP205Q92621 2012 aa14.53□□□□□ -0.08
PSME3-208ENST00000586312 FAM92AA1XBS5 289 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms