RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EHD1Q9H4M9 534 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PSTPIP2Q9H939 334 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HPS4Q9NQG7 708 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GPR27Q9NS67 375 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DACT1Q9NYF0 836 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RGL1Q9NZL6 768 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EMC3Q9P0I2 261 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MALT1Q9UDY8 824 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAG3Q9UGI9 489 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MED16Q9Y2X0 877 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRGP23470 1445 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0B4J269 797 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN14A8MX76 684 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STMND1H3BQB6 276 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 L7N2F9 121 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1CO00159 1063 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 E2F3O00716 465 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 MAPK13O15264 365 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TEX28O15482 410 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MTSS1O43312 755 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TBX18O95935 607 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SCG2P13521 617 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 GAP43P17677 238 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HDCP19113 662 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 IL10P22301 178 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ABCG1P45844 678 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ARFIP1P53367 373 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 AP3M2P53677 418 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TUBA4AP68366 448 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 PTPN21Q16825 1174 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP45Q92619 1136 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NCLNQ969V3 563 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SGK3Q96BR1 496 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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