RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 CNNM3Q8NE01 707 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 FAM167AQ96KS9 214 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SCLT1Q96NL6 688 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TTC1Q99614 292 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NCANO14594 1321 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NEDD4P46934 1319 aa5.69□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 F8W810 466 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PPM1BO75688 479 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DLGAP3O95886 979 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CCNE2O96020 404 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 JMJD7P0C870 316 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ADH6P28332 368 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 KIF5BP33176 963 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TMPRSS15P98073 1019 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NTRK3Q16288 839 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PSMD5Q16401 504 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TICAM2Q86XR7 235 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 YAF2Q8IY57 180 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SVIPQ8NHG7 77 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 COG1Q8WTW3 980 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NUDT8Q8WV74 236 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRN2Q92932 1015 aa5.68□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 TTPALQ9BTX7 342 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GPR88Q9GZN0 384 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 IFT22Q9H7X7 185 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 FBRSQ9HAH7 460 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 WHRNQ9P202 907 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM131Q92545 1883 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.68□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BLACEA4D250 179 aa5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ARL5CA6NH57 179 aa5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 C6P13671 934 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 FLT3P36888 993 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 HAND2P61296 217 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BRD3Q15059 726 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRIM25-208ENST00000574234 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 UBXN11Q5T124 520 aa5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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