RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF185	O15231	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	NPHP1	O15259	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT86	O43790	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ORC4	O43929	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OPHN1	O60890	802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FSBP	O95073	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MBD4	O95243	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PRLR	P16471	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TYRP1	P17643	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SCP2	P22307	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF5B	P33176	963 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PEX19	P40855	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PRPH	P41219	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TDO2	P48775	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GNAQ	P50148	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PPARA	Q07869	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DHX58	Q96C10	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GREM2	Q9H772	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ABCB11	O95342	1321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A087WWV3	80 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PSMA7	O14818	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	LRP5	O75197	1615 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	RECQL4	O94761	1208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDH8	O95206	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	C5	P01031	1676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GYPC	P04921	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CASP14	P31944	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	COPB2	P35606	906 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PHKA1	P46020	1223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	AMPD3	Q01432	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	APBA1	Q02410	837 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MEA1	Q16626	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CFDP1-208	ENST00000569341	AK8	Q96MA6	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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