RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 SGF29Q96ES7 293 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 WNK4Q96J92 1243 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ATP8B1O43520 1251 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GUCY1B2O75343 617 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 APOA1P02647 267 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF286BP0CG31 522 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ODC1P11926 461 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 AKR1B1P15121 316 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GRM4Q14833 912 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ABCC3O15438 1527 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 FAM25AB3EWG3 89 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 FAM25CB3EWG5 89 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 FAM25GB3EWG6 89 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 POLBP06746 335 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 EPHX2P34913 555 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 LIFRP42702 1097 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 DGKZQ13574 1117 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RIN1Q13671 783 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF611Q8N823 705 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MDM1Q8TC05 714 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF711Q9Y462 761 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 UTYO14607 1347 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZBTB39O15060 712 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 KATNA1O75449 491 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CALB1P05937 261 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 LBPP18428 481 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PDX1P52945 283 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 C2CD6Q53TS8 623 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GPRASP2Q96D09 838 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CD209Q9NNX6 404 aa8.73□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MGAT4DA6NG13 374 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TLL1O43897 1013 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2ABP04908 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SARM1Q6SZW1 724 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SMPDL3BQ92485 455 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 KRT38O76015 456 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CPA3P15088 417 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SV2CQ496J9 727 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PXMP2Q9NR77 195 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PRKAG1P54619 331 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RPTNQ6XPR3 784 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SPATA2Q9UM82 520 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SATB2Q9UPW6 733 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 B2RBV5 119 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 WEE2P0C1S8 567 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GTF2A2P52657 109 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RAPSNQ13702 412 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms