RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568153.1

CAPN3-218, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-218ENST00000568153 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SRRDQ9UH36 339 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PTPRFP10586 1907 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KRT86O43790 486 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GFPT2O94808 682 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MCF2P10911 925 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CYP2C9P11712 490 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CYBAP13498 195 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TNFAIP3P21580 790 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PROZP22891 400 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PRKCIP41743 596 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KIF11P52732 1056 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NKX3-2P78367 333 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SLC7A5Q01650 507 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PRKCZQ05513 592 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KIF5AQ12840 1032 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 IKZF1Q13422 519 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PLCL1Q15111 1095 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GAB4Q2WGN9 574 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GJB7Q6PEY0 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 VHLLQ6RSH7 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SEMA4DQ92854 862 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NT5C1BQ96P26 610 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CGRRF1Q99675 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 HDAC8Q9BY41 377 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 DNAI1Q9UI46 699 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 A0A1B0GUA9 196 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ABLIM1O14639 778 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 B4GALT5O43286 388 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 KLF4O43474 513 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 GPR32O75388 356 aa6.58□□□□□ -1.36
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CAPN3-218ENST00000568153 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ERLIN2O94905 339 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 IL18RAPO95256 599 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 PRAMEF1O95521 474 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 PGK1P00558 417 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 HLA-DRAP01903 254 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ESR1P03372 595 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 EDN1P05305 212 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 CLTAP09496 248 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 IQCF3P0C7M6 154 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 STAG3L1P0CL83 205 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 AXLP30530 894 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 USP8P40818 1118 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ARHGAP25P42331 645 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 VAV2P52735 878 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ADAM17P78536 824 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 BIRC3Q13489 604 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 TUBB2AQ13885 445 aa6.58□□□□□ -1.36
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CAPN3-218ENST00000568153 SLC18A3Q16572 532 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 KIZQ2M2Z5 673 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ZACNQ401N2 412 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 WDR49Q8IV35 697 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPN3-218ENST00000568153 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.58□□□□□ -1.36
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