RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CACNB3	P54284	484 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FAM193A	P78312	1265 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	DGCR2	P98153	550 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A3	Q00325	362 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CHRND	Q07001	517 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GRAP	Q13588	217 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	OLFM4	Q6UX06	510 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	AACS	Q86V21	672 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PDPR	Q8NCN5	879 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MASTL	Q96GX5	879 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CEP72	Q9P209	647 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CDYL	Q9Y232	598 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	COL4A1	P02462	1669 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GTW7	788 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GUL7	405 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GOLIM4	O00461	696 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM24	O15164	1050 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MYL1	P05976	194 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ELANE	P08246	267 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	C1S	P09871	688 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RARB	P10826	455 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR2	P21802	821 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR4	P22455	802 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PEX2	P28328	305 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ADORA1	P30542	326 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC7A1	P30825	629 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PDE1A	P54750	535 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TGFB2	P61812	414 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	HSD11B2	P80365	405 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	USP37	Q86T82	979 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PNKP	Q96T60	521 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GPR108	Q9NPR9	543 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934		B8ZZF3	427 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934		M0QYG6	137 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	VPS4B	O75351	444 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NCR1	O76036	304 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KIF20A	O95235	890 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA10	O95299	355 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GPANK1	O95872	356 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MYF5	P13349	255 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KLRK1	P26718	216 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LPIN2	Q92539	896 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		5.25	□□□□□ -1.57

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