RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ATF2P15336 505 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 ERVFC1P60507 584 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 DDR2Q16832 855 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 SPRED2Q7Z698 418 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 IRAK3Q9Y616 596 aa25.08■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 CTAGE9A4FU28 777 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ELF1P32519 619 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GPM6BQ13491 265 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 KIF18AQ8NI77 898 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 BTBD6Q96KE9 485 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.07■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ZBED1O96006 694 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SLC5A3P53794 718 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 NUP93Q8N1F7 819 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM7Q9C029 511 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GRM6O15303 877 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CSPG5O95196 566 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJB1P25685 340 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PEX26Q7Z412 305 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 JOSD2Q8TAC2 188 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SPATA17Q96L03 361 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CYP4F11Q9HBI6 524 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 AMFRQ9UKV5 643 aa25.06■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 H3BNC9 293 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 TNFRSF10BO14763 440 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GRAP2O75791 330 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 FTCDO95954 541 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 USP17L7P0C7H9 530 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 DESP17661 470 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GPR15P49685 360 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 DAOAP59103 153 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SCML4Q8N228 414 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 FNIP1Q8TF40 1166 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 IRGQQ8WZA9 623 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA1Q92805 767 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GUCD1Q96NT3 240 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.05■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PRRG1O14668 218 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 HSF2BPO75031 334 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SOAT2O75908 522 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PROSCO94903 275 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GLI1P08151 1106 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 KLRC2P26717 231 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ARCQ7LC44 396 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 EMC1Q8N766 993 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ALG6Q9Y672 507 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 USP3Q9Y6I4 520 aa25.04■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 FSCN2O14926 492 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SPOPO43791 374 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 GPD1P21695 349 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PSMA2P25787 234 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SLC1A1P43005 524 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 ALDH1A3P47895 512 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 CERS4Q9HA82 394 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 SEC24AO95486 1093 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 PDGFRAP16234 1089 aa25.03■■□□□ 1.6
MEIS3-204ENST00000558555 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms