RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		K7EQS6	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HUS1	O60921	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TACC1	O75410	805 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	IL2RA	P01589	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PFKL	P17858	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SYT1	P21579	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LHX1	P48742	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RBP5	P82980	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYL7	Q01449	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TSPY1	Q01534	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CEP68	Q76N32	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CD101	Q93033	1021 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	DCLK1	O15075	740 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	GREM1	O60565	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNK5	O95279	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	GCNT3	O95395	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	APBB3	O95704	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	CYP17A1	P05093	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	CKM	P06732	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	HDC	P19113	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	PCSK1	P29120	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	MPL	P40238	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	CLDN10	P78369	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC7A9	P82251	487 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC7B-210	ENST00000556749	AMPD2	Q01433	879 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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