RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TTC30A	Q86WT1	665 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	STKLD1	Q8NE28	680 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CXorf38	Q8TB03	319 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	C8orf48	Q96LL4	319 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SYT15	Q9BQS2	421 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRIM9	Q9C026	710 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PANK4	Q9NVE7	773 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LHX6	Q9UPM6	363 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	E2F8	A0AVK6	867 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SGK1	O00141	431 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CFI	P05156	583 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADH5	P11766	374 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	BDNF	P23560	247 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZXDB	P98169	803 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GAD2	Q05329	585 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KCNA1	Q09470	495 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CAMK4	Q16566	473 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OSTM1	Q86WC4	334 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PROSER1	Q86XN7	944 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GPD1L	Q8N335	351 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HMGB4	Q8WW32	186 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MYLPF	Q96A32	169 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PCED1B	Q96HM7	432 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HPDL	Q96IR7	371 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RNF38	Q9H0F5	515 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TNMD	Q9H2S6	317 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	INTS13	Q9NVM9	706 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CPQ	Q9Y646	472 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	USP24	Q9UPU5	2620 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP33	O14559	1287 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADAM23	O75077	832 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ATP2C2	O75185	946 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TACC1	O75410	805 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ABL1	P00519	1130 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TNNC2	P02585	160 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GNS	P15586	552 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ITPKA	P23677	461 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LMO2	P25791	158 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC6A11	P48066	632 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TUB	P50607	506 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	USP46	P62068	366 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CYP27A1	Q02318	531 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF33A	Q06730	810 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TAF10	Q12962	218 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	EMC10	Q5UCC4	262 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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