RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 SCML4Q8N228 414 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 USP18Q9UMW8 372 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP1CC-208ENST00000551676 RARAP10276 462 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PBX3P40426 434 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RABGGTBP53611 331 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 DAOAP59103 153 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF280DQ6N043 979 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RAPGEF5Q92565 580 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HERPUD2Q9BSE4 406 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 OSBPL8Q9BZF1 889 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 OR4Q2P0C623 313 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RALAP11233 206 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 DESP17661 470 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MCM3P25205 808 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MATKP42679 507 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 VSNL1P62760 191 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MFSD7Q6UXD7 560 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CEP57Q86XR8 500 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 H7C4K7 107 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RAD51CO43502 376 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PHF2O75151 1096 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ACRP10323 421 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TAZQ16635 292 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RAB6CQ53S08 254 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 IRGQQ8WZA9 623 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PEBP4Q96S96 227 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TTPALQ9BTX7 342 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ZWILCHQ9H900 591 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 KLHL11Q9NVR0 708 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 STIM2Q9P246 746 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 USP3Q9Y6I4 520 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 VWA8A3KMH1 1905 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC151A5D8V7 595 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ZBED1O96006 694 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ATP11AP98196 1134 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 DEFB106AQ8N104 65 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC26Q8TAB7 109 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NT5C3BQ969T7 300 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 B3GALT6Q96L58 329 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CYP2F1P24903 491 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CHRNA3P32297 505 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NOS2P35228 1153 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CDKN2BP42772 138 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGEA11P43364 429 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HDAC4P56524 1084 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC7A5Q01650 507 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 BOLA3Q53S33 107 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RTP2Q5QGT7 225 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ANKS3Q6ZW76 656 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 STRADAQ7RTN6 431 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MAATS1Q7Z4T9 603 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 IGSF21Q96ID5 467 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 LRRC19Q9H756 370 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 EFR3BQ9Y2G0 817 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PTPRDP23468 1912 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TNFRSF10BO14763 440 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PRPSAP2O60256 369 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ENDOD1O94919 500 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CLCN6P51797 869 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms