RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TOR1B	O14657	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	AREL1	O15033	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FOXS1	O43638	330 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G6	O60733	806 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NDST3	O95803	873 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	COMT	P21964	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GCSH	P23434	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ACVR2A	P27037	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GRK6	P43250	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	WNT3	P56703	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CSRP2	Q16527	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GPR162	Q16538	588 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	INSC	Q1MX18	579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MNT	Q99583	582 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089		H7C4K7	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LEFTY2	O00292	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RGS10	O43665	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RECQL4	O94761	1208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RASAL1	O95294	804 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GPANK1	O95872	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	IL1R1	P14778	569 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TYRP1	P17643	537 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ITGAL	P20701	1170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PAX3	P23760	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	VIPR2	P41587	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LILRA4	P59901	499 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HSD11B2	P80365	405 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SNX27	Q96L92	541 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	C5	P01031	1676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1B0GTW7	788 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GPR42	O15529	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FDXR	P22570	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCT5	P48643	541 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CPT1A	P50416	773 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRKAG1	P54619	331 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FPGS	Q05932	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZACN	Q401N2	412 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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