RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RASA4BC9J798 803 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NCAM2O15394 837 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RASA4O43374 803 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RECQL4O94761 1208 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CSF1RP07333 972 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ABCB4P21439 1286 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ADD2P35612 726 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1AP35813 382 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PRIM2P49643 509 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MPP1Q00013 466 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 VPS53Q5VIR6 699 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ANKS6Q68DC2 871 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KIF6Q6ZMV9 814 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OR2C3Q8N628 320 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 REPS2Q8NFH8 660 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CEP95Q96GE4 821 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 STAP2Q9UGK3 403 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TMX2Q9Y320 296 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CDHR2Q9BYE9 1310 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 EYA2O00167 538 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CYR61O00622 381 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RPS6KA4O75676 772 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GFPT2O94808 682 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CD4P01730 458 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ACVRL1P37023 503 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FLT3LGP49771 235 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A3Q00325 362 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TAF11Q15544 211 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RETSATQ6NUM9 610 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZVL8 140 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SYNE4Q8N205 404 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 HPS3Q969F9 1004 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1191Q96A73 305 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PDP2Q9P2J9 529 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AK9Q5TCS8 1911 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PEX11BO96011 259 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MAKP20794 623 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AGXTP21549 392 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SMARCA1P28370 1054 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MCAMP43121 646 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PDE1AP54750 535 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAM193AP78312 1265 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TNFAIP2Q03169 654 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PPP3CAQ08209 521 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TTC22Q5TAA0 569 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF276Q8N554 614 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 JADE3Q92613 823 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TFAP2CQ92754 450 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NDC1Q9BTX1 674 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM24O15164 1050 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ENDOD1O94919 500 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ADH4P08319 380 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 POU2F2P09086 479 aa4.69□□□□□ -1.66
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