RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 RUNX3Q13761 415 aa24■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 THAP9Q9H5L6 903 aa24■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 SCML2Q9UQR0 700 aa24■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 HECTD3Q5T447 861 aa23.99■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 EBF3Q9H4W6 596 aa23.99■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.99■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 SGO2Q562F6 1265 aa23.98■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.98■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM270Q6UE05 265 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 RRAGAQ7L523 313 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.97■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 CHRNB1P11230 501 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 IFNAR2P48551 515 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 EML3Q32P44 896 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 RAB41Q5JT25 222 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 OSER1Q9NX31 292 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.96■■□□□ 1.43
FAM200B-218ENST00000512855 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.96■■□□□ 1.43
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FAM200B-218ENST00000512855 CYP26A1O43174 497 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 TLR5O60602 858 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 CD19P15391 556 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 BCAT1P54687 386 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 PIGZQ86VD9 579 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.95■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 TFAP2BQ92481 460 aa23.95■■□□□ 1.42
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FAM200B-218ENST00000512855 CHRDQ9H2X0 955 aa23.95■■□□□ 1.42
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FAM200B-218ENST00000512855 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 MBD3O95983 291 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF132P52740 706 aa23.94■■□□□ 1.42
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FAM200B-218ENST00000512855 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 CPA6Q8N4T0 437 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 PHOX2BQ99453 314 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 IER2Q9BTL4 223 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 NMUR1Q9HB89 426 aa23.94■■□□□ 1.42
FAM200B-218ENST00000512855 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.94■■□□□ 1.42
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